包裝鏈高度自動化國內藥廠的大部分包裝工作，包裝機械設備,特別是較復雜的包裝物品的排列、裝配等工作基本上是人工操作，難以保證包裝的統一和穩定，可能造成對被包裝產品的污染。有些藥廠即使使用包裝機械，也只是應用在整個包裝鏈的某個環節上，例如前段包裝采用機械包裝，而后段包裝則采用人工。因此，提高整個包裝鏈的自動化水平和質量水平，是現代化制藥企業推行GMP規范非常重要的一環。真正的現代化包裝機械的每個機械手均應由電腦控制，并具有對材質及厚度的高分辨能力。
控制功能智能化控制系統是機械設備的大腦，也是下達動作指令的核心裝置。目前，藥品包裝機械生產廠家普遍使用可編程控制器(PLC控制器)，這種設備不具有工業電腦(PC)所擁有的強大功能。對于多數傳統機械控制設備來說，采用PLC是適當的，因為需要控制參數的數量有限，很多地方仍然采用機械方式控制，例如，扭矩控制就是利用機械離合器來對電機進行過載保護的。然而，隨著設備自動化程度的提高，計算機控制設備越來越多，應用到設備上的各種傳感部件、檢測部件、控制部件、執行元件的數量非常龐大，此時PLC就無法對如此眾多的參數進行管理和控制了，而工業PC將是最好的選擇。
機械功能多元化醫藥產品已趨向精致化和多元化方向發展，單品種大批量的產品越來越少，而多品種小批量的產品日益成為主流。在大環境的變化趨勢下，多元化、具有多種切換功能，能適應多種包材和模具更換的包裝機才能夠適應市場的需求。例如，在一臺泡罩包裝機上既能進行“鋁塑”包裝又能進行“鋁鋁”包裝，且要求切換簡單，所需更換的模具少。而目前，更換模具的時間一般在1～2個小時，如此長的時間無法適應多品種小批量的生產要求。
